MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPN034183 draft genome

Total Repeats: 32631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021028	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	480535789
2	NC_021028	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	480535789
3	NC_021028	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535789
4	NC_021028	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	480535789
5	NC_021028	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535789
6	NC_021028	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
7	NC_021028	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
8	NC_021028	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
9	NC_021028	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	480535789
10	NC_021028	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
11	NC_021028	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
12	NC_021028	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	480535789
13	NC_021028	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	480535789
14	NC_021028	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	480535789
15	NC_021028	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535789
16	NC_021028	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535789
17	NC_021028	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	480535789
18	NC_021028	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535789
19	NC_021028	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535789
20	NC_021028	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	480535789
21	NC_021028	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535789
22	NC_021028	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
23	NC_021028	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	480535789
24	NC_021028	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	480535789
25	NC_021028	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	480535789
26	NC_021028	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	480535789
27	NC_021028	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	480535789
28	NC_021028	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535789
29	NC_021028	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	480535790
30	NC_021028	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	480535790
31	NC_021028	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
32	NC_021028	AG	3	6	1761	1766	50 %	0 %	50 %	0 %	480535790
33	NC_021028	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	480535790
34	NC_021028	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
35	NC_021028	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
36	NC_021028	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535790
37	NC_021028	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
38	NC_021028	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	480535790
39	NC_021028	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535790
40	NC_021028	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535790
41	NC_021028	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	480535790
42	NC_021028	A	6	6	2267	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	480535790
43	NC_021028	A	7	7	2283	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	480535790
44	NC_021028	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
45	NC_021028	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535790
46	NC_021028	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535790
47	NC_021028	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535790
48	NC_021028	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	480535790
49	NC_021028	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535790
50	NC_021028	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	480535790
51	NC_021028	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	480535790
52	NC_021028	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535790
53	NC_021028	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
54	NC_021028	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	480535791
55	NC_021028	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	480535791
56	NC_021028	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535791
57	NC_021028	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535791
58	NC_021028	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535791
59	NC_021028	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
60	NC_021028	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
61	NC_021028	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535792
62	NC_021028	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	480535792
63	NC_021028	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
64	NC_021028	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	480535792
65	NC_021028	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	480535792
66	NC_021028	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
67	NC_021028	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
68	NC_021028	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	480535792
69	NC_021028	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
70	NC_021028	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
71	NC_021028	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535792
72	NC_021028	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	480535792
73	NC_021028	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	480535792
74	NC_021028	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	480535792
75	NC_021028	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
76	NC_021028	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	480535792
77	NC_021028	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535792
78	NC_021028	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535792
79	NC_021028	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
80	NC_021028	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535792
81	NC_021028	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	480535792
82	NC_021028	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	480535793
83	NC_021028	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	480535793
84	NC_021028	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	480535793
85	NC_021028	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535793
86	NC_021028	AC	3	6	4485	4490	50 %	0 %	0 %	50 %	480535793
87	NC_021028	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	480535793
88	NC_021028	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	480535793
89	NC_021028	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
90	NC_021028	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
91	NC_021028	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535793
92	NC_021028	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535793
93	NC_021028	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
94	NC_021028	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535793
95	NC_021028	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
96	NC_021028	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535793
97	NC_021028	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535793
98	NC_021028	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
99	NC_021028	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	480535794
100	NC_021028	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
101	NC_021028	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	480535794
102	NC_021028	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
103	NC_021028	TATC	2	8	5146	5153	25 %	50 %	0 %	25 %	480535794
104	NC_021028	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
105	NC_021028	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	480535794
106	NC_021028	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	480535794
107	NC_021028	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	480535794
108	NC_021028	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535794
109	NC_021028	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	480535794
110	NC_021028	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
111	NC_021028	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
112	NC_021028	T	6	6	5523	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	480535794
113	NC_021028	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
114	NC_021028	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	480535794
115	NC_021028	GA	3	6	5630	5635	50 %	0 %	50 %	0 %	480535794
116	NC_021028	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
117	NC_021028	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
118	NC_021028	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
119	NC_021028	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
120	NC_021028	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	480535794
121	NC_021028	TCAAT	2	10	6047	6056	40 %	40 %	0 %	20 %	480535794
122	NC_021028	TTTTC	2	10	6087	6096	0 %	80 %	0 %	20 %	480535794
123	NC_021028	AGA	2	6	6101	6106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535794
124	NC_021028	A	7	7	6120	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	480535794
125	NC_021028	ATT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	480535794
126	NC_021028	GGA	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	480535794
127	NC_021028	CGT	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	480535794
128	NC_021028	ACA	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535794
129	NC_021028	AG	3	6	6380	6385	50 %	0 %	50 %	0 %	480535794
130	NC_021028	TGT	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535794
131	NC_021028	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	480535794
132	NC_021028	AT	3	6	6569	6574	50 %	50 %	0 %	0 %	480535794
133	NC_021028	TAAAT	2	10	6605	6614	60 %	40 %	0 %	0 %	480535794
134	NC_021028	TGA	2	6	6671	6676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
135	NC_021028	ACTCT	2	10	6686	6695	20 %	40 %	0 %	40 %	480535794
136	NC_021028	TGA	4	12	6731	6742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535794
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268	NC_021028	ATG	2	6	12818	12823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535801
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270	NC_021028	GTA	2	6	12870	12875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535801
271	NC_021028	AGC	2	6	12883	12888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	480535801
272	NC_021028	AGA	2	6	12895	12900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	480535801
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274	NC_021028	GTT	2	6	12962	12967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535801
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290	NC_021028	TGA	2	6	13618	13623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	480535801
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293	NC_021028	TTG	2	6	13722	13727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	480535801
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398	NC_021028	CAA	2	6	25925	25930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	480535806
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